麻醉科創建于1980年，現已發展成為集醫療、教學、科研為一體的一級臨床科室。科室現有麻醉醫師39人及麻醉護士5人，其中主任醫師3人，副主任醫師8人，技術力量雄厚，人才結構合理。科室擁有各種先進的設備以及多種特殊功能測量儀，能承擔各種類型及疑難雜癥的手術麻醉，并開展急慢性疼痛治療、舒適化診療如：無痛人流、分娩鎮痛、無痛胃腸鏡、無痛氣管鏡等，麻醉質量及安全性達到國內先進水平。科室專門開設麻醉專家門診，進一步方便患者就診。在教學方面，科室承擔福建中醫藥大學研究生、本科生的教學任務以及臨床醫師的培訓工作。在科研方面，綜合實力較強，近年來獲得福建省醫學科技獎1項，承擔省、廳級科研項目30余項。